（1）股東的身份不被認(rèn)可。由于股份代持協(xié)議實(shí)際出資人的姓名并不記載于工商登記資料上，那么在法律上股份代持協(xié)議實(shí)際出資人的股東地位是不被認(rèn)可的，股東的表決權(quán)、分紅權(quán)、增資優(yōu)先權(quán)、剩余財(cái)產(chǎn)分配權(quán)等一系列的權(quán)利都需要由代持股人行使，必然導(dǎo)致風(fēng)險(xiǎn)的存在。同時(shí)代持股人轉(zhuǎn)讓股份、質(zhì)押股份的行為，股份代持協(xié)議實(shí)際出資人都很難控制。

（2）代持股人惡意損害實(shí)際股東的利益。包括代持股人濫用經(jīng)營管理權(quán)、表決權(quán)、分紅權(quán)、增資優(yōu)先權(quán)、剩余財(cái)產(chǎn)分配權(quán)等權(quán)利給股份代持協(xié)議實(shí)際出資人造成的財(cái)產(chǎn)損失。

（3）由于代持股人自身原因?qū)е略V訟而被法院凍結(jié)保全或者執(zhí)行名下的代持股權(quán)。當(dāng)代持股人出現(xiàn)其他不能償還的債務(wù)時(shí)，法院和其他有權(quán)機(jī)關(guān)可以依法查封上述股權(quán)，并將代持股權(quán)用于償還代持股人的債務(wù)。股份代持協(xié)議實(shí)際出資人如果未能及時(shí)阻止，只有依據(jù)股份代持協(xié)議向代持股人主張賠償責(zé)任。

（4）代持股人意外死亡引發(fā)繼承或離婚糾紛等。如果代持股人意外死亡，則其名下的股權(quán)作為財(cái)產(chǎn)將有可能涉及繼承或離婚分割的法律糾紛。股份代持協(xié)議實(shí)際出資人不得不卷入相關(guān)糾紛案件中，才能維護(hù)自己的財(cái)產(chǎn)權(quán)。